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GST pull-down

更新時間:2024-09-26

簡要描述:

GST pull-down
利用重組技術(shù)將探針蛋白與GST(Glutathione S transferase)融合,融合蛋白通過GST與固相化在載體上的GTH(Glutathione)親和結(jié)合,已廣泛應(yīng)用于分子生物學(xué)(1)證實兩種蛋白可能有相互作用(2)尋找能與已知蛋白發(fā)生相互作用的未知蛋白。

GST pull-down

利用重組技術(shù)將探針蛋白與GST(Glutathione S transferase)融合,融合蛋白通過GST與固相化在載體上的GTH(Glutathione)親和結(jié)合,已廣泛應(yīng)用于分子生物學(xué)(1)證實兩種蛋白可能有相互作用(2)尋找能與已知蛋白發(fā)生相互作用的未知蛋白。



GST pull-down實驗方法原理

利用重組技術(shù)將探針蛋白與GST(Glutathione S transferase)融合,融合蛋白通過GST與固相化在載體上的GTH(Glutathione)親和結(jié)合。因此,當(dāng)與融合蛋白有相互作用的蛋白通過層析柱時或與此固相復(fù)合物混合時就可被吸附而分離。

GST-pulldown主要包括以下三個部分:①利用基因重組技術(shù)構(gòu)建帶有GST標(biāo)簽的原核表達(dá)載體;②通過原核表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)帶有GST標(biāo)簽的融合蛋白;③利用GST親和純化柱進(jìn)行蛋白純化獲得高純度的融合蛋白,再利用GST親和純化柱進(jìn)行蛋白間的相互作用檢測。

實驗操作程序:

材料及試劑

探針蛋白與GST融合的原核蛋白,裂解的細(xì)胞蛋白,或者組織蛋白提取物

細(xì)胞蛋白裂解液,洗脫液:PBS及PBS+1%Triton-100

(以下流程僅供研究已知原核蛋白A和真核過表達(dá)蛋白B相互作用)

1:原核融合蛋白A的獲得

1.1:將編碼蛋白A與GST的重組質(zhì)?;D(zhuǎn)BL21(DE3)菌株

1.2:挑取單個克隆到含有5mlLB(+100ug/mlAmp)的10ml試管里,37℃培養(yǎng)過夜

1.3:將培養(yǎng)菌液轉(zhuǎn)移到含有500ml LB(+100ug/mlAmp)的1L錐形瓶中,37℃,225rpm培養(yǎng)至OD600≈1.0-1.5左右,加入適當(dāng)濃度的IPTG,在適當(dāng)溫度下培養(yǎng)適當(dāng)時間(誘導(dǎo)條件需要根據(jù)不同的蛋白做調(diào)整),6000g,10分鐘,4℃離心收集細(xì)菌,去盡上清,將菌體至于-20℃放置O/N

1.4:室溫凍融菌體,馬上置于冰上,每500ml培養(yǎng)液加入10-20ml細(xì)菌裂解液(PBS+1%Triton-100+PMSF),吹打混勻

1.5:冰上超聲破碎,開2秒,停9秒,總40-60分鐘。至裂解液充分清涼

1.6:11000rpm,15分鐘,4℃離心分離上清, -80℃保存?zhèn)溆?/span>

2:真核融合蛋白B的獲得

2.1:將編碼B蛋白的堿基序列克隆到編碼標(biāo)簽蛋白(如HA,或者myc)的真核表達(dá)載體上,進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染

3:48小時后,取適量融合蛋白GST-A 于冰上凍融

4:取50-70ulGST-Beads(Immobilized Glutathione)到EP管中,用800ul PBS+1%Triton-100潤洗一次,將凍融融合蛋白GST-A與之混勻,4℃層析柜旋轉(zhuǎn)結(jié)合1小時。

5:PBS+1%Triton-100洗3次,PBS洗3次。留取20ul( PBS+Beads)作Offer。

6:同時,裂解真核融合蛋白B,去盡培養(yǎng)基,用PBS(RT)洗一次,加入300ul裂解液(以6well為例,PBS+1%Triton-100+ Cocktaier),4℃放置30分鐘。

7:吹打收集至1.5mlEP管,超聲破碎。13000rpm,15分鐘,4℃離心取上清。

8:BCA蛋白定量(optional)留取20ul做Offer,其余樣品加入到已純化蛋白的EP管中,用PBS補(bǔ)足液體到600ul左右,以便蛋白之間能充分結(jié)合!4℃旋轉(zhuǎn)結(jié)合O/N9:PBS+1%Triton-100洗3次,PBS洗3次。

10:40ul 5×loading buffer溶解beads上的蛋白,煮沸3分鐘,高速離心,Run –SDS PAGE做Western Blot檢測。用HA或者myc Blot

注意事項

內(nèi)源性蛋白的干擾使得實驗出現(xiàn)的假陽性結(jié)果較多:

(1)高純度的GST融合蛋白能夠減少實驗的假陽性。由于高純度的融合蛋白能減少實驗結(jié)果的假陽性,因此獲得高純度的融合蛋白對于GST-pull down 實驗結(jié)果 分析具有重要的作用。同時,為了能夠盡可能的保證融合蛋白原有的生物學(xué)活性,一般在獲取融合蛋白時傾向于可溶性融合蛋白,因此獲得高純度的可溶性蛋白很關(guān)鍵。

(2)對于可溶性蛋白的獲得條件主要有①載體的選擇。②可溶性蛋白表達(dá)條件的選擇,③誘導(dǎo)溫度,④誘導(dǎo)時間,⑤誘導(dǎo)物的濃度,能夠不被細(xì)胞代謝而且具有穩(wěn)定的濃度。


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